Mit vereinter Turtle-Power treten Michaelangelo, Donatello, Leonardo und Raphael jetzt gegen noch miesere Schurken an. Natürlich kämpft April O'Neil (Megan Fox) an ihrer Seite - und ein neuer Verbündeter: Hockeymasken-Träger Casey Jones (Stephen Amell). Superbösewicht Shredder entkommt und engagiert für seinen teuflischen Welteroberungsplan die beiden muskelbepackten, hirnlosen Kampf-Mutanten Bebop (Gary Anthony Williams) und Rocksteady (Stephen "Shaemus" Farrelly). Bevor sich die Kröten-Helden jedoch diese Schurkentrupe schnappen können, müssen sie sich einer noch größeren Bedrohung stellen: dem berüchtigten Krang.