Ein abtrünniger Vulkanier (Laurence Luckinbill) mit einem erstaunlichen Geheimnis entführt die Enterprise, um einen mystischen Planeten zu finden. Kirk (William Shatner) und seine Mannschaft machen sich auf, um den Verrückten zu stoppen. Ihre Reise führt sie ins Zentrum des Universums, vors Angesicht Gottes. Während die Crew unter dem Einfluss des Vulkaniers steht, muss Kirk sich auf eine merkwürdige Allianz einlassen, um die Galaxie zu retten.